CRM zarządza relacjami z klientami i historią sprzedaży – to narzędzie przede wszystkim dla działu handlowego. Marketing automation automatyzuje działania marketingowe na podstawie zachowań – to narzędzie dla działu marketingu. Oba systemy działają najlepiej razem i często są integrowane lub oferowane w jednym ekosystemie (np. HubSpot).